Sin embargo, detrás de la promesa de desarrollo, el proyecto ha acumulado cuestionamientos por deficiencias de planeación y supervisión, observaciones financieras, problemas de documentación del mantenimiento y accidentes ferroviarios
El exoficial mayor de la Sedesol y la Sedatu afirma que cuenta con información que involucra a Rosario Robles y a Enrique Peña Nieto con 'La Estafa Maestra'