Sin embargo, detrás de la promesa de desarrollo, el proyecto ha acumulado cuestionamientos por deficiencias de planeación y supervisión, observaciones financieras, problemas de documentación del mantenimiento y accidentes ferroviarios
De acuerdo con lo señalado, Daniel Noboa perdió la mayoría que tenía en el Congreso luego de que 51 legisladores de Revolución Ciudadana se pasó de lado de la oposición, Asamblea Nacional de Ecuador, perdiendo la mayoría.
Sin embargo, detrás de la promesa de desarrollo, el proyecto ha acumulado cuestionamientos por deficiencias de planeación y supervisión, observaciones financieras, problemas de documentación del mantenimiento y accidentes ferroviarios